存在的问题是：对法律制度的个别内容存在不同理解；制度中的个别规定还未得到落实，相关配套措施还有待制定；促进科技成果转化激励政策的落实仍存在若干体制机制性障碍。对此，报告建议，有关主管部门研究制定配套措施；研究完善科技成果转化的有关法律制度；完善高等院校及科研机构成果转化激励机制等与科技成果转化有关的配套政策；进一步建立健全财政性资金科技项目成果转化的多渠道投入机制；全面落实财政性资金科技项目知识产权管理措施。

　　关于科学技术进步法第三十三条规定的鼓励企业增加研究开发和技术创新投入的制度，报告指出，实施效果较好，成效逐步显现。企业研发投入力度加大，对制度满意度高。同时，还存在享受研发费用加计扣除制度优惠的企业总数依然偏少，配套措施还不够完善；研发仪器设备加速折旧和对引进技术进行消化吸收再创新制度实施力度有待进一步加强等问题。

　　报告建议，完善加计扣除制度的配套措施，增强制度的操作性和执行力度；梳理技术引进消化吸收再创新的相关规定，完善配套措施；完善协调机制，解决实施中的问题。