作为行使审判权的人民法院、行使检察权的人民检察院、行使侦查权的公安(国家安全)机关、行使刑罚执行-卡又的司法行政机关，在国家司法体制中因其性质、职权不同而形成有机联系。

    《一)人民法院和人民检察院同属于国家司法机关。只是分工不同

    按照法律规定，人民法院和人民检察院同属于司法机关，分别行使审判权和检察权。这与西方国家不同，在大多数西方国家，司法机关仅指法院，检察机关不是专门的司法机关，有的依附于法院，有的是行政机关或者依附于某个行政机关(如美国司法部下设检察院)。我国宪法明确规定：“人民法院是国家的审判机关”，“依照法律规定独立行使审判权”；“人民检察院是国家的法律监督机关”，“依照法律规定独立行使检察权”。

    (二)人民法院、人民检察院上下级关系不同

    我国宪法和人民法院组织法规定，最高人民法院是最高审判机关，监督地方各级人民法院和专门人民法院的审判工作，上级人民法院监督下级人民法院的审判工作。最高人民法院对各级人民法院已经发生法律效力的判决和裁定，上级人民法院对下级人民法院已经发生法律效力的判决和裁定，如果发现确有错误，有权提审或者指令下级人民法院再审。宪法和人民检察院组织法规定，最高人民检察院是最高检察机关，领导地方各级人民检察院和专门人民检察院的工作，上级人民检察院领导下级人民检察院的工作。可见，人民法院上下级之间是监督与被监督的关系，人民检察院上下级之间是领导与被领导的关系。

    (三)人民法院、人民检察院和公安机关办理刑事案件分工负责、互相配合、互相制约

    宪法规定：“人民法院、人民检察院和公安机关办理刑事案件，应当分工负责，互相配合，互相制约，以保证准确有效地执行法律。”

    ——分工负责是指公安机关、检察院和法院等在处理刑事案件工作中按照法律规定各司其职，各负其责，既不能互相推诿，也不互相代替。按照刑事诉讼法规定，对刑事案件，经检察院批准或法院决定，公安机关负责侦查、拘留、执行逮捕；人民检察院负责批准逮捕和提起公诉，还负责国家工作人员职务犯罪案件侦查和提起公诉；人民法院负责检察院提起公诉和被害人提起自诉案件的审判。

    ——互相配合，是指公安机关、检察院和法院等在分工负责的基础上互相支持，协调，共同完成工作任务。

    ——互相制约，是指公安机关、检察院和法院互相监督，互相约束，防止发生错误和及时纠正错误。例如，公安机关逮捕犯罪嫌疑人时，必须报请检察院批准；检察院提起公诉后，法院对犯罪事实不清、证据不足的可以驳回起诉；法院判决后，检察院对有错误的判决可以提起抗诉，法院认为抗诉无理的可以驳回抗诉；监狱和其他执行机关在刑罚执行中，如果认为判决有错误，应当转请检察院或者原判法院处理。作为法律监督机关，人民检察院有权对侦查、审判和刑事执行工作实施监督。另外，上级司法机关对下级司法机关的监督也是制约，如人民法院的审判监督程序、死刑复核程序等。

    (四)司法行政机关负责人民法院判处刑罚的执行，并受人民检察院的监督

    人民法院判处罪犯死刑缓期2年执行、无期徒刑、有期徒刑的刑罚，由司法行政机关负责执行(罪犯在被交付执行刑罚前，剩余刑期在1年以下的由看守所代为执行)。人民检察院在监狱派驻检察员，对执行刑罚的活动是否合法，实行监督。如果发现有违法情况，有权通知执行机关纠正。

    另外，根据全国人大常委会关于完善人民陪审员制度的决定的规定，人民法院和司法行政机关共同选任、培训、考核人民陪审员。